MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Agrobacterium radiobacter K84 chromosome 2

Total Repeats: 51700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011983	AGC	2	6	162	167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080823
2	NC_011983	GCT	2	6	290	295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080823
3	NC_011983	AAG	2	6	432	437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080823
4	NC_011983	GAG	2	6	462	467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080823
5	NC_011983	GGC	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080823
6	NC_011983	CCA	2	6	520	525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080823
7	NC_011983	GATCC	2	10	678	687	20 %	20 %	20 %	40 %	222080823
8	NC_011983	TCAT	2	8	700	707	25 %	50 %	0 %	25 %	222080823
9	NC_011983	CCG	2	6	769	774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080823
10	NC_011983	GGC	2	6	798	803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080823
11	NC_011983	CAT	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080823
12	NC_011983	CGAAC	2	10	1073	1082	40 %	0 %	20 %	40 %	222080823
13	NC_011983	CTT	2	6	1293	1298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080823
14	NC_011983	CGC	2	6	1393	1398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080824
15	NC_011983	TCGCCG	2	12	1406	1417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222080824
16	NC_011983	TCT	2	6	1420	1425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080824
17	NC_011983	CGC	2	6	1432	1437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080824
18	NC_011983	GCT	2	6	1480	1485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080824
19	NC_011983	CAT	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080824
20	NC_011983	ACG	2	6	1619	1624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080824
21	NC_011983	GAC	3	9	1680	1688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080824
22	NC_011983	GAA	2	6	1775	1780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080824
23	NC_011983	CGA	2	6	1792	1797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080824
24	NC_011983	TCGC	2	8	1874	1881	0 %	25 %	25 %	50 %	222080824
25	NC_011983	TGC	2	6	1908	1913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080824
26	NC_011983	TGC	2	6	1957	1962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080824
27	NC_011983	GCC	2	6	1974	1979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080824
28	NC_011983	GCT	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080824
29	NC_011983	CTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080824
30	NC_011983	CAA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080825
31	NC_011983	ACG	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080825
32	NC_011983	GCG	2	6	2803	2808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080825
33	NC_011983	GGCC	2	8	2830	2837	0 %	0 %	50 %	50 %	222080825
34	NC_011983	GAG	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080825
35	NC_011983	GCA	2	6	2968	2973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080825
36	NC_011983	A	6	6	2987	2992	100 %	0 %	0 %	0 %	222080825
37	NC_011983	GCC	2	6	3027	3032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080825
38	NC_011983	GAA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080825
39	NC_011983	GA	3	6	3098	3103	50 %	0 %	50 %	0 %	222080825
40	NC_011983	CG	3	6	3134	3139	0 %	0 %	50 %	50 %	222080825
41	NC_011983	GAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080825
42	NC_011983	TGC	2	6	3183	3188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080825
43	NC_011983	ATC	2	6	3197	3202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080825
44	NC_011983	ATG	2	6	3246	3251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080825
45	NC_011983	CAG	2	6	3374	3379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080825
46	NC_011983	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080825
47	NC_011983	CAG	2	6	3480	3485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080825
48	NC_011983	GTC	2	6	3569	3574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080825
49	NC_011983	GCCT	2	8	3578	3585	0 %	25 %	25 %	50 %	222080825
50	NC_011983	GCA	2	6	3598	3603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080825
51	NC_011983	TCAGC	2	10	3606	3615	20 %	20 %	20 %	40 %	222080825
52	NC_011983	CGAGG	2	10	3709	3718	20 %	0 %	60 %	20 %	222080825
53	NC_011983	CAT	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080825
54	NC_011983	ATC	2	6	3730	3735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080825
55	NC_011983	GCC	2	6	3754	3759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080826
56	NC_011983	ACA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080826
57	NC_011983	T	6	6	3796	3801	0 %	100 %	0 %	0 %	222080826
58	NC_011983	ACG	2	6	3842	3847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080826
59	NC_011983	GATC	2	8	4089	4096	25 %	25 %	25 %	25 %	222080826
60	NC_011983	GCA	2	6	4110	4115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080826
61	NC_011983	GA	3	6	4116	4121	50 %	0 %	50 %	0 %	222080826
62	NC_011983	CACG	2	8	4159	4166	25 %	0 %	25 %	50 %	222080826
63	NC_011983	TC	3	6	4248	4253	0 %	50 %	0 %	50 %	222080826
64	NC_011983	CGAT	2	8	4361	4368	25 %	25 %	25 %	25 %	222080826
65	NC_011983	TTCG	2	8	4741	4748	0 %	50 %	25 %	25 %	222080827
66	NC_011983	GTC	2	6	4761	4766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080827
67	NC_011983	GGCT	2	8	4783	4790	0 %	25 %	50 %	25 %	222080827
68	NC_011983	AAGG	2	8	4866	4873	50 %	0 %	50 %	0 %	222080827
69	NC_011983	ATA	2	6	4900	4905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080827
70	NC_011983	TCGA	2	8	4968	4975	25 %	25 %	25 %	25 %	222080827
71	NC_011983	TGC	2	6	4994	4999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080827
72	NC_011983	ATCGA	2	10	5031	5040	40 %	20 %	20 %	20 %	222080827
73	NC_011983	GCA	2	6	5225	5230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080827
74	NC_011983	GGC	2	6	5297	5302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080827
75	NC_011983	GGA	2	6	5312	5317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080827
76	NC_011983	ACA	2	6	5350	5355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080827
77	NC_011983	ACC	2	6	5373	5378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080827
78	NC_011983	CGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080827
79	NC_011983	GAC	2	6	5508	5513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080827
80	NC_011983	AGC	2	6	5524	5529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080827
81	NC_011983	CGA	2	6	5554	5559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080827
82	NC_011983	ACGA	2	8	5652	5659	50 %	0 %	25 %	25 %	222080827
83	NC_011983	CGA	2	6	5666	5671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080827
84	NC_011983	GGC	2	6	5798	5803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080828
85	NC_011983	CAT	2	6	5818	5823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080828
86	NC_011983	GCT	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
87	NC_011983	CGGC	2	8	5865	5872	0 %	0 %	50 %	50 %	222080828
88	NC_011983	GTC	2	6	5883	5888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
89	NC_011983	CCG	2	6	5897	5902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080828
90	NC_011983	TCAC	2	8	5952	5959	25 %	25 %	0 %	50 %	222080828
91	NC_011983	CAC	2	6	5968	5973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080828
92	NC_011983	TTC	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080828
93	NC_011983	ATC	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080828
94	NC_011983	GC	3	6	6053	6058	0 %	0 %	50 %	50 %	222080828
95	NC_011983	GATC	2	8	6064	6071	25 %	25 %	25 %	25 %	222080828
96	NC_011983	TCT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080828
97	NC_011983	TCG	2	6	6237	6242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
98	NC_011983	GCG	2	6	6283	6288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080828
99	NC_011983	TGC	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
100	NC_011983	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
101	NC_011983	GCC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080828
102	NC_011983	TCT	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080828
103	NC_011983	CAA	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080828
104	NC_011983	GCC	2	6	6452	6457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080828
105	NC_011983	CTG	3	9	6497	6505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080828
106	NC_011983	CG	3	6	6609	6614	0 %	0 %	50 %	50 %	222080829
107	NC_011983	CGG	2	6	6665	6670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080829
108	NC_011983	GCT	2	6	6692	6697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080829
109	NC_011983	GTC	2	6	6759	6764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080829
110	NC_011983	TCT	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080829
111	NC_011983	CAA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080829
112	NC_011983	CGT	2	6	6873	6878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080829
113	NC_011983	A	6	6	6900	6905	100 %	0 %	0 %	0 %	222080829
114	NC_011983	GCC	2	6	6925	6930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080829
115	NC_011983	GGC	2	6	6951	6956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080829
116	NC_011983	TGC	2	6	7006	7011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080829
117	NC_011983	CG	3	6	7048	7053	0 %	0 %	50 %	50 %	222080829
118	NC_011983	ACC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080829
119	NC_011983	CGA	2	6	7127	7132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080829
120	NC_011983	ATC	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080829
121	NC_011983	GCC	2	6	7489	7494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080830
122	NC_011983	ACCGA	2	10	7516	7525	40 %	0 %	20 %	40 %	222080830
123	NC_011983	CGA	2	6	7529	7534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080830
124	NC_011983	CGC	2	6	7549	7554	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080830
125	NC_011983	CCG	2	6	7640	7645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080830
126	NC_011983	GCC	2	6	7697	7702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080830
127	NC_011983	TGC	2	6	7752	7757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080830
128	NC_011983	CG	3	6	7763	7768	0 %	0 %	50 %	50 %	222080830
129	NC_011983	GCAGAT	2	12	7781	7792	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222080830
130	NC_011983	GCCG	2	8	7898	7905	0 %	0 %	50 %	50 %	222080830
131	NC_011983	TCCGC	2	10	7943	7952	0 %	20 %	20 %	60 %	222080830
132	NC_011983	GCCG	2	8	7971	7978	0 %	0 %	50 %	50 %	222080830
133	NC_011983	GC	3	6	8049	8054	0 %	0 %	50 %	50 %	222080830
134	NC_011983	GCC	2	6	8089	8094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080830
135	NC_011983	GAG	2	6	8289	8294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080831
136	NC_011983	CG	3	6	8302	8307	0 %	0 %	50 %	50 %	222080831
137	NC_011983	TGGC	2	8	8333	8340	0 %	25 %	50 %	25 %	222080831
138	NC_011983	CCG	2	6	8386	8391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080831
139	NC_011983	GACC	2	8	8428	8435	25 %	0 %	25 %	50 %	222080831
140	NC_011983	CGATG	2	10	8450	8459	20 %	20 %	40 %	20 %	222080831
141	NC_011983	TCGGT	2	10	8525	8534	0 %	40 %	40 %	20 %	222080831
142	NC_011983	G	6	6	8551	8556	0 %	0 %	100 %	0 %	222080831
143	NC_011983	CTG	2	6	8603	8608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080831
144	NC_011983	GAAC	2	8	8632	8639	50 %	0 %	25 %	25 %	222080831
145	NC_011983	GAG	2	6	8796	8801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080831
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148	NC_011983	ATC	2	6	8937	8942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080831
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150	NC_011983	ATG	2	6	9105	9110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080831
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152	NC_011983	CCA	2	6	9122	9127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080831
153	NC_011983	GCAA	2	8	9197	9204	50 %	0 %	25 %	25 %	222080832
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157	NC_011983	GC	3	6	9361	9366	0 %	0 %	50 %	50 %	222080832
158	NC_011983	ATG	2	6	9389	9394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080832
159	NC_011983	CAG	3	9	9424	9432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080832
160	NC_011983	AG	3	6	9435	9440	50 %	0 %	50 %	0 %	222080832
161	NC_011983	CCG	2	6	9461	9466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080832
162	NC_011983	ATC	3	9	9497	9505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080832
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164	NC_011983	GGC	2	6	9565	9570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080832
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167	NC_011983	CCA	2	6	9675	9680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080832
168	NC_011983	GCC	2	6	9695	9700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080832
169	NC_011983	CGC	2	6	9823	9828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080832
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172	NC_011983	CAT	2	6	9993	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080832
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174	NC_011983	GGC	2	6	10093	10098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080832
175	NC_011983	TCAGGA	2	12	10113	10124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222080832
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259	NC_011983	TGC	2	6	13941	13946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080834
260	NC_011983	GCGCA	2	10	13947	13956	20 %	0 %	40 %	40 %	222080834
261	NC_011983	CGC	2	6	13960	13965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080834
262	NC_011983	CGGC	2	8	14022	14029	0 %	0 %	50 %	50 %	222080834
263	NC_011983	ACC	2	6	14042	14047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080834
264	NC_011983	GAC	2	6	14089	14094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080834
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267	NC_011983	CAG	2	6	14185	14190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080834
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281	NC_011983	GCG	2	6	14753	14758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080834
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290	NC_011983	GCG	2	6	15161	15166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080834
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383	NC_011983	TGCGC	2	10	19531	19540	0 %	20 %	40 %	40 %	222080835
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386	NC_011983	CGA	2	6	19639	19644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080835
387	NC_011983	GTT	2	6	19648	19653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080835
388	NC_011983	ACA	2	6	19677	19682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080835
389	NC_011983	TCG	2	6	19689	19694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080835
390	NC_011983	AGA	2	6	19737	19742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080835
391	NC_011983	TAT	2	6	19865	19870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080835
392	NC_011983	CGT	2	6	19918	19923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080835
393	NC_011983	GATGCG	2	12	19955	19966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222080835
394	NC_011983	CGA	3	9	19981	19989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080835
395	NC_011983	TCG	2	6	20001	20006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080835
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399	NC_011983	CGAT	2	8	20205	20212	25 %	25 %	25 %	25 %	222080835
400	NC_011983	ATGC	2	8	20280	20287	25 %	25 %	25 %	25 %	222080835
401	NC_011983	AGA	2	6	20301	20306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080835
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420	NC_011983	TCG	2	6	21492	21497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080836
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500	NC_011983	GGC	2	6	24671	24676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080839

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